不同主考院校颁发的自考毕业证书，含金量有差别吗？

没有实质差别。按教育部规定，通过自学考试取得的学历均属国民教育系列，国家承认，毕业证书可在学信网电子注册查询，可用于考研、考公务员、职称评定等用途。院校之间的差异主要体现在专业特长和助学资源上，而非学历本身的认可度。